Анализ эпидемии коронавируса в России

Заказчик

Консорциум CoRGI​

Исполнитель

Международная лаборатория статистической и вычислительной геномики​

Руководитель проекта

PhD Щур Владимир Львович​

Партнеры

Сколтех (Москва), НИИ гриппа (Санкт-Петербург), ИППИ (Москва)​

Цель исследования

Анализ эпидемии коронавируса SARS-CoV-2 в России.​

Результаты

Определено, что в Россию коронавирус завозился несколько десятков раз.​ Большинство завозов случились в конце февраля - первой половине марта из Европы.​ Вирус был завезен в Россию не менее 67 раз.​ Следов завозов инфекции из Китая нет.​ Выполнен байесовский анализ филодинамики вспышки Covid-19 в НИИ им.Вредена (Санкт Петербург) с использованием пакета BEAST2.​ Определен эффект карантина,​ Обнаружено от двух до трёх независимых заносов инфекции в больницу.​

Перспективы

Изучение внутрипациентской изменчивости коронавируса SARS-CoV-2:​ Разработка нового метода для определения вариантов вируса, циркулирующих в популяции,​ Планируется разработка моделей, учитывающих​ передачу нескольких вариантов вируса между пациентами.​

Публикации

Komissarov et al. Genomic epidemiology of the early stages of SARS-CoV-2 outbreak in Russia // Nature Communications, 2021 (Q1)​

Рисунки