• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Прикладное программное обеспечение суперкомпьютера НИУ ВШЭ

Уважаемые пользователи!

Вы можете самостоятельно устанавливать программные пакеты в свой каталог на суперкомпьютере. В случае если у вашей научной группы есть сложности с установкой какого-либо открытого программного обеспечения на суперкомпьютер или если вы считаете, что какое-либо ПО должно быть установлено централизованно и быть доступным для всех пользователей, оставьте заявку на портале поддержки пользователей.

Для работы с установленным программным обеспечением используйте команду module (см. использование модулей).

Программные комплексы
 
НаименованиеОписание
MATLAB Full SuiteСреда и язык технических расчетов, предназначенный для решения широкого спектра инженерных и научных задач любой сложности в любых отраслях. Дополнительно установлены библиотеки для расширения возможностей MATLAB.
GROMACSПакет программ  для моделирования физико-химических процессов в молекулярной динамике.
LAMMPSСвободно распространяемый программный пакет для решения задач молекулярной динамики. Обеспечивает возможность расчётов особо крупных задач (до десятков миллионов атомов).
Quantum ESPRESSOПрограммный пакет для расчетов электронной структуры и моделирования материалов на наноуровне. Основан на теории функционала плотности, плоских волнах и псевдопотенциалах.
GNU OctaveСвободная система для математических вычислений, использующая совместимый с MATLAB язык высокого уровня.
BEAST, BEAST2Программный пакет для филогенетического анализа с акцентом на масштабированные по времени деревья.
IQ-TREEПрограммный пакет для филогенетического вывода с использованием критерия максимального правдоподобия (ML - maximum likelihood).
OpenBUGS, JAGSПрограммные пакеты для анализа байесовских иерархических моделей с использованием моделирования цепей Маркова Монте-Карло (MCMC).
Специализированные программные библиотеки
 
НаименованиеОписание
OpenPoseБиблиотека для обнаружения ключевых точек в режиме реального времени для оценки тела, лица, рук и ног
FFTWБиблиотека для вычисления дискретных преобразований Фурье.
GSL, SAMtools, ANGSD и HTSlibУтилиты и библиотеки для обработки фрагментов секвенированной ДНК.
BEAGLEВысокопроизводительная библиотека, используемая для филогенетического анализа.
cnpyБиблиотека для возможности использования в C++ массивов из NumPy, сохранённых в форматах .npy и .npz.
AdmixToolsБиблиотеки и утилиты для обработки популяционных данных.
OpenBLASРеализация API-интерфейсов BLAS и LAPACK с открытым исходным кодом с множеством вручную созданных оптимизаций для конкретных типов процессоров.

См. также системное программное обеспечение суперкомпьютера НИУ ВШЭ

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!
Сервис предназначен только для отправки сообщений об орфографических и пунктуационных ошибках.